Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms