Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntd1Q9D995 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms