Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D979 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D979 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D979 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D979 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D979 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D979 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms