Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms