Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms