Protein–RNA interactions for Protein: Q9D820

Prorsd1, Prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prorsd1Q9D820 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prorsd1Q9D820 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prorsd1Q9D820 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms