Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cyp2c55Q9D816 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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