Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms