Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Srp19Q9D7A6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Srp19Q9D7A6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Srp19Q9D7A6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Srp19Q9D7A6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp19Q9D7A6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Srp19Q9D7A6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp19Q9D7A6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms