Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms