Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Necab3Q9D6J4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms