Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms