Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms