Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms