Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn11Q9D572 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms