Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms