Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ribc2Q9D4Q1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ribc2Q9D4Q1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ribc2Q9D4Q1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ribc2Q9D4Q1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms