Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lonrf3Q9D4H7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms