Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syce1Q9D495 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms