Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh2Q9D489 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms