Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms