Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms