Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Krt20Q9D312 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt20Q9D312 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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