Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig1Q9D2J4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms