Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim42Q9D2H5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms