Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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