Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Necap2Q9D1J1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms