Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms