Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms