Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms