Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms