Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Zbed3Q9D0L1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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