Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms