Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shisa9Q9CZN4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Shisa9Q9CZN4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms