Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thumpd2Q9CZB3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms