Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PmpcbQ9CXT8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms