Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exo5Q9CXP9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms