Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms