Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cnot11Q9CWN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot11Q9CWN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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