Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms