Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms