Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms