Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms