Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms