Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms