Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska2Q9CR46 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms