Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms