Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc43Q9CR29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms