Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 755 ms