Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms